อาคารเหนือมีตู้ปลากลางแจ้งขนาดใหญ่ที่สุดในญี่ปุ่น สระน้ำหลักมีขนาด 60x30 เมตรและลึก 12 เมตร อัฒจันทร์ในร่มจุผู้ชมมากถึง 3,000 คน ที่ต่างกระตือรือร้นที่จะเพลิดเพลินกับความบันเทิงและสาระความรู้จากการแสดงสัตว์น้ำ รองรับโดยจอภาพขนาดใหญ่ความคมชัดสูงที่ฉากหลังของสระน้ำ

ตู้ปลาหลักมีหน้าต่างข้างบานใหญ่บนชั้นสอง ที่สามารถเห็นภาพอันน่าตื่นตาของฝูงปลาโลมาและปลาวาฬเพชฌฆาตออก้า ปลาวาฬเพชฌฆาตและปลาโลมาที่ฉลาดและซุกซนมักจะว่ายมาใกล้ผนังกระจกและดูเหมือนจะทักทายผู้มาเยือน การได้เห็นสัตว์ทะเลปฏิสัมพันธ์โดยเฉพาะกับเด็กๆ นับเป็นช่วงเวลามหัศจรรย์สำหรับทุกคน
นอกจากนี้ ยังสามารถชมปลาวาฬขาวเบลูก้า และการแสดงที่สนุกสนานของพวกมัน ที่ทำให้ทั้งเด็กๆ และเหล่าผู้หญิงในกลุ่มผู้ชมต่างพากันร้องระงมว่า "คาวาอิ คาวาอิ" (น่ารัก น่ารัก)

อาคารใต้ของพิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำจัดวางออกเป็น 5 เขตที่แตกต่างกัน และจัดแสดงว่าสัตว์หลากหลายสายพันธุ์มีการปรับตัวให้เข้ากับสภาพแวดล้อมของอย่างไร
หนึ่งในไฮไลต์ของอาคารใต้คือ ตู้ปลาคุโระชิโอะขนาดยักษ์ ที่เต็มไปด้วยฝูงปลาสีเงินประกายว่ายฉวัดเฉวียน และสัตว์ทะเลที่มีขนาดใหญ่กว่าจากทั่วประเทศญี่ปุ่น
แกลเลอรี่ทะเลลึกแนะนำสิ่งมีชีวิตที่อาศัยอยู่ในความเงียบสงบและความมืดของทะเลลึก ขณะที่ตู้ปลาขนาดยักษ์ที่จัดแสดงแนวปะการังก็เปรียบเสมือนกล้องคาเลโดสโคปที่สะท้อนสีละลานตาของสัตว์ทะเล
ตู้ปลาของเต่าทะเลอพยพ จะทำให้คุณได้จ้องตากับหนึ่งในสปีชีส์ใกล้สูญพันธุ์แห่งมหาสมุทร การเฝ้ามองเต่าทะเลขนาดยักษ์ที่เชื่องช้าและสง่างามเป็นการผ่อนคลายที่ดีที่สุด
ระบบนิเวศน์อีกแห่งหนึ่งที่น่าดึงดูดใจคือ ส่วนจัดแสดงน้ำจืดทวีปออสเตรเลีย ที่มีทั้งเต่า ปลา และสัตว์ในแม่น้ำหลากหลายสายพันธุ์ที่พบได้ในออสเตรเลียเท่านั้น
สัตว์ทะเลทวีปแอนตาร์กติกา เพนกวินเอนเคาน์เตอร์ ก็เป็นอีกจุดที่ได้รับความนิยม โดยผู้คนต่างหยุดและนั่งบนระเบียงเพื่อชมพฤติกรรมพิลึกที่น่าดูของเหล่าเพนกวินด

พิพิธภัณฑ์สัตว์น้ำท่าเรือนาโกย่าล้อมรอบไปด้วยจุดเที่ยวชมและสถานที่น่าสนใจอื่นๆ อีกมากมาย
อย่าแปลกใจถ้าหนึ่งวันเต็มของคุณจะถูกกลืนหายไปทั้งหมดด้วยฝูงปลา!